Système bio-inspiré pour la comparaison de séquences génétiques

La comparaison des séquences génomiques ou protéomiques est aujourd'hui essentielle pour la plupart des applications bio-technologiques. La taille des séquences et des bases de données les contenant rend cette tâche, réalisée essentiellement par logiciel, très longue et fastidieuse. L'existence de processeurs spécialisés permettrait de réduire drastiquement le temps de calcul. Ce projet propose la conception et réalisation d'un accélérateur pour la comparaison des séquences, partageant de façon optimale les différentes tâches entre le matériel et le logiciel.

Etudiant: Alistair Doswald

Année: 2005

Département: TIC

Filière: Informatique et systèmes de communication (anciennement Informatique)

Type de formation: Plein temps

Partenaire externe: HEIG-VD/REDS

Enseignant responsable: Andres Perez-Uribe

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